اداره تخصصی و فوق تخصصی به عنوان یکی از مهم ترین بخش های آموزش دانشگاه، نقش اساسی در تربیت پزشکان و متخصصان توانمند در حوزه های تخصصی و فوق تخصصی دارد.این اداره در جهت بهبود و ارتقای کیفیت آموزش اهداف زیر را دنبال می کند: ارتقاء کیفیت برنامه های آموزشی، توسعه ظرفیت های بالینی، گسترش برنامه های بین المللی و توسعه مهارت های حرفه ای و اخلاقی